Su importancia en la biología, el manganeso tiene aplicaciones industriales significativas, siendo utilizado en la fabricación de aleaciones de acero, baterías y aditivos alimentarios.

En el entorno acuático, las especies más comunes de manganeso son el Mn^2+ reducido y el Mn^4+ oxidado. La química del manganeso, en muchos aspectos, refleja la del hierro. En el agua subterránea, el manganeso tiende a estar presente en su forma reducida (Mn^2+). Sin embargo, al entrar en contacto con el aire u otros oxidantes, el manganeso presente en el agua subterránea puede precipitar como MnO2 negro, lo que puede provocar manchas en instalaciones de plomería, lavandería y utensilios de cocina.

Para medir los niveles de manganeso en muestras de agua, se utilizan métodos fotométricos que se basan en el principio de absorbancia de Beer-Lambert. Estos métodos emplean reactivos que generan un color proporcional a la concentración de manganeso en la muestra. Entre los productos disponibles para este tipo de análisis se incluyen colorímetros portátiles, fotómetros de mesa, así como espectrofotómetros. Los métodos de análisis fotométrico varían según el rango de concentración a medir, desde adaptaciones del método PAN para rangos bajos hasta adaptaciones del Método Periodate de los Métodos Estándar para el Examen de Aguas y Aguas Residuales para rangos más altos.