La clorinación de suministros de agua y aguas contaminadas es utilizada principalmente para destruir o desactivar microorganismos productores de enfermedades. También sirve para mejorar la calidad de aguas potables, ya que el cloro reacciona con el amoniaco, el hierro, el manganeso, el azufre y algunas sustancias orgánicas.

Sin embargo, grandes cantidades de cloro producirán efectos adversos, como la formación de compuestos que son potencialmente carcinógenos (p.ej. cloroformo) o dañinos para la vida acuática (p.ej. cloraminas). Por tanto, es esencial controlar que se haya agregado la cantidad apropiada de cloro para cumplir con el propósito primario de desinfectar y minimizar cualquier efecto adverso.